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集团签合同分公司付款是可以的，前提是分公司有营业执照有一定的财产支配权。如果分公司有独立的营业执照，签订的合同在分公司的经营范围之内，分公司也可以开发票，但是合同也要以分公司名义签订。只要到当地税务机关进行纳税登记，并在所在地纳税。
《最高人民法院关于适用中华人民共和国民事诉讼法若干问题的意见》
第四十条
民事诉讼法第四十九条规定的其他组织是指合法成立、有一定的组织机构和财产，但又不具备法人资格的组织，包括： （1）依法登记领取营业执照的私营独资企业、合伙组织； （2）依法登记领取营业执照的合伙型联营企业； （3）依法登记领取我国营业执照的中外合作经营企业、外资企业； （4）经民政部门核准登记领取社会团体登记证的社会团体； （5）法人依法设立并领取营业执照的分支机构； （6）中国人民银行、各专业银行设在各地的分支机构； （7）中国人民保险公司设在各地的分支机构； （8）经核准登记领取营业执照的乡镇、街道、村办企业； （9）符合本条规定条件的其他组织。
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